学习WGCNA总结 Transcriptomics

学习WGCNA总结

在转录组数据处理过程中我们经常会用到差异表达分析这一概念,通过比较不同处理或不同组织间基因表达量(FPKM)差异来寻找特异基因,但这前提是你的不同处理或不同组织样本较少,当不同处理或组织有较多样本,如...
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RNA-Seq基因表达水平衡量方法 Transcriptomics

RNA-Seq基因表达水平衡量方法

小编注:近年来RNA-Seq被广泛应用,衡量基因表达水平的方法也开始多样化,例如RPK, RPKM, FPKM, TPM等。那他们之间有什么样的区别、以及怎样换算呢。最近看到一篇不错的博客,这里与大家...
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GSEA使用介绍 Transcriptomics

GSEA使用介绍

在前面的《GSEA简介》中,简单介绍GSEA,以及GSEA分析调用的后台数据库MsigDB。下面简单介绍GSEA的使用。 第一步、下载GSEA软件: 下载地址:http://software.broa...
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GSEA简介 Transcriptomics

GSEA简介

基因集富集分析 (Gene Set Enrichment Analysis, GSEA)的基本思想是使用预定义的基因集(通常来自功能注释或先前实验的结果),将基因按照在两类样本中的差异表达程度排序,然...
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