在之前的Evolview系列文章已为大家介绍过进化树与条形图、点图、热图以及蛋白结构域组合绘制，今天重点介绍进化树的装饰以及按簇进行分组美化。比如，学习绘制Evolview最美的一个展示案例（show...
Evoview：进化树的装饰与美化
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EvolView: 进化树+条形图：“组合图”的绘制
经常有童鞋问如何绘制进化树和条形图、热图等的组合图，大神们经常会推荐大家用iTol。但由于iTOL是国外的网站，于是大家经常会遇到iTOL无法登陆的情况。 今天为大家介绍一个类似iTOL的进化树在线美...
Average Nucleotide Identity (ANI) 计算
ANI概念 Average Nucleotide Identity (ANI) 是在核酸水平，两两基因组之间所有直系同源蛋白编码基因的相似性，常用于研究基因组之间的进化距离。相较于传统的 DNA-DN...
群体遗传学–Fst指数
群体遗传学中衡量群体间分化程度的指标有很多种，最常用的就是Fst指数。Fst指数，由F统计量演变而来。F统计量（FIS，FIF，FST）主要有三种。Fst是针对一对等位基因，如果基因座上存在复等位基因...
“进化树+点状图”组合图的绘制
在之前的3篇关于EvolView文章中已介绍过进化树的调整和注释，并重点介绍了进化树与条形图、热图、蛋白结构域的组合操作。这次为大家介绍另一种常见的组合图：进化树+点状图。 由于内容上有...
如何绘制“松针”状的进化树
在一些高分文章中，我们经常会看到一些非常漂亮的进化树，而进化树的美化往往离不开一些进化树编辑可视化工具。比如下图这篇NC文章的进化树就是由MEGA构建，之后用一款叫FigTree的小工具美化的。 &n...
EvolView画进化树+热图：组合图的绘制
上一篇《进化树+条形图：“组合图”的绘制》介绍了如何通过改变标尺来改变进化树分支长度和进化树的注释，相信大家对进化树与其他类型图表的组合有了一定的了解，局限于微信公众号的篇幅，其实还有好多东西没有讲到...
进化树+图片：组合图的绘制
在一些高分文章中我们会看到类似下图这种添加了图片进化树，颜值高而且更直观。在之前已经介绍过进化树和条形图、热图、点状图、结构域示意图等的组合，但Evolview并不支持进化树和图片的组合。 （Natu...
用iTOL轻松绘制高颜值系统进化树
时至今日，科研文章也紧随时代潮流，文章中各种高大上的配图层出不穷。究其原因主要包括两点：一是在科研数据和内容更加丰满而文章发表配图张数受限的情况下组合图更具实用性；二是一幅高颜值的配图不仅能提升文章的...
QTL 定位的原理
1. 连锁分析的基本原理 既然群体中产生了多样性，我们就期望将与性状相关的基因定位出来。在之前的文章中，我们提到功能基因定位的方法主要包括QTL定位（包含GWAS）和群体遗传（选择压力分析）。这里的Q...