microRNA是癌症个性化医疗的希望，人们一直希望能够解析它们的确切作用机理，并将其应用于临床。然而事实证明，这是一项充满挑战性的工作。 MicroRNA是可以沉默基因表达的非编码单链短RNA分子。...
盘点癌症中的microRNA
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miRTarbase简介
miRTaebase是台湾那边搞的一个专门收集有实验证据支持microRNA及其靶基因间关系的数据库，虽然收录数据不多但是还是蛮好用的，抽了点时间把资料整理了一下。整个数据库内容下载下来一张Excel...
推荐GPB上关于microRNA研究专题综述
最近中国科学院北京基因组研究所的《Genomics, Proteomics & Bioinformatics》（GPB）杂志出了一期microRNA的专题刊。由Yu Jun和 Li Tongb...
sRNAMAP:细菌small noncoding RNA数据库
Small non-coding RNAs近年来一直研究比较热门，尤其是在真核生物中。因此PLoB网站上面也专门开辟了ncRNA专栏来介绍这一块的研究进展。最近在做一个细菌的转录组课题，需要鉴定其中的...
miRNA测序结果分析
miRNA研究现在是如火中天了，不少同学现在也开始从事这方面研究。有些同学常常会迷惑，因为不知道到底需要做哪些研究。下面简单和大家分享一下miRNA测序后分析的主要内容有哪些。 一、基因注释（推荐） ...
psRobot :小分子RNA整合分析软件
植物小分子RNA，主要包括microRNA和小干扰RNA，在基因的转录和转录后调控过程中具有重要作用。第二代测序技术的逐渐成熟和广泛应用极大地推动了小分子RNA相关研究的发展，对不同组织和材料中的小分...
非编码RNA预测软件
[1] Family specific gene prediction software: (1)tRNAscan-SE: Search for tRNA genes in genomic seque...
非编码RNA与基因组调控网络
摘要 在复杂的生物体中，基因的表达水平是通过转录因子和其它调控蛋白综合作用调控的结果，有些调控蛋白甚至能够决定细胞的命运，近来大量的研究也证实了这一观点。但也有研究表明基因组存在着广泛的转录事件，产生...
Small RNA测序相关问题集锦
Small RNA是一大类调控分子，几乎存在于所有的生物体中。Small RNA包括：miRNA、ncRNA、siRNA、snoRNA、piRNA、rasiRNA等等。Small RNA通过多种多样的...
microRNA相关的数据库与预测、功能分析软件
miRBase: http://www.mirbase.org miRBase序列数据库是一个提供包括已发表的miRNA序列数据、注释、预测基因靶标等信息的全方位数据库，是存储miRNA信息最主要的公...