wapRNA:RNA与microRNA分析工具

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所属分类:ncRNA

wapRNA是一个RNA序列数据处理的网络平台,支持RNA和microRNA两种序列分析。它集成了多种分析工具,为处理下一代测序技术平台,如(Solexa,SOLiD)产出的RNA序列数据提供了便利。通过计算分析,wapRNA可以为研究者提供多种序列信息,如:基因表达量,基因水平突变,基因功能;在microRNA方面,注释已知的microRNA,预测新的microRNA,预测靶基因等。

wapRNA的特点:

  • 基于web,操作简单。
  • 支持两种测序数据:SOLiD和Solexa。
  • 短序列比对,并且提供比对结果。
  • 基于ENSEMBLE,TIGR,BROAD等的序列注释。
  • 基于序列比对和文本注释进行数据挖掘。
  • 流程集成了常用的功能分析工具(GO,KEGG)。


服务器网址:http://waprna.big.ac.cn/

相关软件下载链接:http://waprna.big.ac.cn/rnaseq/download/download.jsp

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    • avatar boya888 3

      http://waprna.big.ac.cn)。国际期刊Bioinformatics
      研发人员还集成了一些常用的功能分析模块,比如基因差异表达分析(DEGseq)、代谢通路分析(KEGG)、Gene Ontology分析(Go)和miRNA靶基因预测(Target prediction)等,以及可以在本地执行的程序包,可以方便地在本地计算机上安装使用。
      软件外包不少啊!任重道远! :neutral:
      [img]http://good.gd/2100921.htm[/img]

      • avatar boya888 3

        http://waprna.big.ac.cn软件下载截图
        下载wapRNA.jpg