贝纳基因第二期生物信息培训开始报名啦！欢迎生物圈的朋友们来捧场！ 1、本次培训不收取任何费用； 2、本次培训面向全国的生命科学研究领域的老师、研究生； 3、所有讲师都有三年以上生物信息从业经验，在na...
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纵观转录组研究
如今人们进行转录组分析大多是在第二代测序平台上进行RNA-seq，将样品中的RNA反转录为cDNA，构建测序文库，再进行测序分析。随着RNA-seq技术的逐渐普及，自然也出现了许多RNA-seq分析工...
RNA-seq拼接结果数据提交NCBI
RNA-seq的拼接结果也可以向NCBI提交，第一次提交，还是费了不少事，这里简单总结一下。RNA-seq的拼接结果应该提交到TSA库，TSA全称Transcriptome Shotgun Assem...
RNA-seq数据分析方法
最近读到一篇Nature Method上一篇关于RNA-seq数据分析的文章，觉得很不错，杜宇刚开始多转录组分析的同学很有帮助，里面还介绍了一些关于可变剪接的问题。 下面列上列上的基本信息： Comp...
最新研究质疑RNA测序数据的统计分析
过去几年间，高通量RNA测序已经取得了一些意想不到的成果，其中一些似乎是能够改写传统遗传学智慧的突破性发现。但是，这些调查结果现在受到了挑战，计算生物学家警告说，在这些数据密集型研究（data-int...
测序数据分析工具大全
目前有不少用于基因组装配和比对的程序和算法，但是该选哪一个呢？许多序列分析的专家认为，这取决于基因组的大小、读取有多长，以及采用的是哪种测序技术。通常，软件还需要优化，以满足每个实验室的独特需求。在此...
RNA-PET— 在基因组范围对5’和3’ 双末端标签的RNA-Seq进行全长转录本分析
RNA-PET是一种用第二代测序平台（Illumina GA和SOLiD）分析全长转录本的双末端标签（PET）测序的方法。和传统的随机剪断序列成短片段的RNA-Seq方法不同，RNA-PET捕获并测序...
GenomicTools:一个高通量分析基因组的扩展计算平台
GenomicTools是一个灵活的计算平台，主要用来分析和处理高通量测序数据，比如RNA-Seq 和 ChIP-Seq。GenomicTools可以完成在基因组区域集中各种数学运算，因此可以设计一个...
GenePattern:一个强大的基因组学分析平台
GenePattern是一个强大的基因组学分析平台，该平台整合了大量的基因表达分析、蛋白质组学分析、SNP分析、流式细胞分析、RNA-seq数据分析以及一些常规的生物信息学分析工具。 以下是官方介绍：...
转录组测序（RNA-seq）技术
转录组是某个物种或者特定细胞类型产生的所有转录本的集合。转录组研究能够从整体水 平研究基因功能以及基因结构，揭示特定生物学过程以及疾...