RNA-PET— 在基因组范围对5’和3’ 双末端标签的RNA-Seq进行全长转录本分析

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所属分类:Transcriptomics

RNA-PET是一种用第二代测序平台(Illumina GA和SOLiD)分析全长转录本的双末端标签(PET)测序的方法。和传统的随机剪断序列成短片段的RNA-Seq方法不同,RNA-PET捕获并测序所有表达基因的全长cDNA片段的5’和3’末端标签。除了量化每个表达基因的转录水平,当定位到参考基因组时,RNA-PET测序还可以在基因组范围内区分转录单位的界限。

RNA-PET测序的基本流程和原理

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Full-Length Transcript Analysis Using 5′ and 3′ Paired-End-Tag Next Generation Sequencing (RNA-PET). Methods Mol Biol 809,535-62 【Abstract

资料来源:转录组博客(www.ablifehome.com/blog)

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