TranscriptomicsPaired-End Tags (PET)用于转录组分析 PET概述 将由各种前期实验得到较长的DNA片段,取出其前后两个端的小段序列,称作Paired-End Tags, 将这些tags进行测序然后map到基因组上,从这两个tags就可以知道得到了基因组上... 09月27日4,627评论NGS 转录组 阅读全文
TranscriptomicsBEDTools使用详细说明 简介 1、概述 BEDTools是可用于genomic features的比较,相关操作及进行注释的工具。而genomic features通常使用Browser Extensible Data (B... 09月26日32,6126Transcriptome 转录组 阅读全文
TranscriptomicsRunning newbler: de novo transcriptome assembly I Since version 2.3, newbler has a -cdna option for de novo transcriptome assembly. In this post, I’ll... 03月30日2,0281 拼接 转录组 阅读全文
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ncRNAwapRNA:RNA与microRNA分析工具 wapRNA是一个RNA序列数据处理的网络平台,支持RNA和microRNA两种序列分析。它集成了多种分析工具,为处理下一代测序技术平台,如(Solexa,SOLiD)产出的RNA序列数据提供了便利。... 11月26日2,3562mRNA RNAseq 阅读全文