大数据与生命科学 Advance

大数据与生命科学

原文来自《生命科学研究快报》,游文娟 编译 编者按: 2014年6月13日,《科学》杂志刊载了一篇由美国科学促进会(AAAS)科技出版顾问Mike May撰写的一篇题为“Big Biological ...
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PacBio:你了解多少? Genomics

PacBio:你了解多少?

原文作者:陈巍学基因; 原文标题《PacBio单分子超长测序》部分图片PLoB有修改 测序原理: 1. 用4种荧光分别标记4种dNTP 2. 在测序芯片的底部做出许多用与入射光波长相应的小孔,特定的孔...
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如何检测超低频突变? Advance

如何检测超低频突变?

肿瘤是高度异质性的,其中致病突变可能以极低比例存在,比如allel frequency< 0.1%~0.01%,甚至更低。而目前最准的Hiseq测序本身的单个碱基的错误率就在0.2%左右,再加上...
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单细胞测序技术概览 Advance

单细胞测序技术概览

2013年,单细胞测序技术开始成为科研界主流关注的焦点。 前言 2013年,单细胞测序技术(single-cell sequencing)荣膺《自然-方法》年度技术。单细胞测序技术有助于我们剖析细胞的...
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测序量估计 Genomics

测序量估计

考虑这样一个问题,“如果要保证基因组上95%的区域其覆盖深度在30x以上的话,那么最低的平均测序深度应该是多少?”。 关于测序量的估计,对于做生物信息的人来讲应算是家常便饭了,多数时候我们都能直接根据...
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Pyrosequencing测序原理视频 Bioinformatics

Pyrosequencing测序原理视频

每个dNTP被聚合酶加到DNA链上时,都会放一个焦磷酸分子 焦磷酸可以被焦磷酸酶降解成一个ATP和一个AMP 荧火虫酶能够把ATP再水解,同时发出一个荧光光子 测序时,把4个dNTP轮番加入反应体系中...
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RNA测序研究现状与发展 Transcriptomics

RNA测序研究现状与发展

通常来说,某一个物种体内所有细胞里含有的DNA都应该是一模一样的,只是因为每一种细胞里所表达的RNA之间存在差异,才使这些细胞有所区别。诸如“为什么肿瘤细胞与正常细胞会不一样?”这样的重要问题都可以通...
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