目的: 鉴定该物种中某个基因家族的所有成员; 每个基因的功能鉴定; 什么是HMM: HMM(Hidden Markov Model,隐马尔科夫模型)是一种用参数表示的用于...
Phrap 与Phred使用方法快速入门
本文主要介绍 phred\phrap-基因组的序列装配软件包。Phred 是 phred\phrap 软件包 的一部分,主要是用来分析和装配基因组中大片段序列。phred\phrap 软件包由华盛顿大...
序列以及序列比对中常见术语
有些你看着知道,其实让你说,又说不出多少;有些你以为自己知道,但你不知道自己仅仅了解了其中的一部分。许多概念,虽说只是一个词,但是其背后是一个专业的领域模型,每一个概念在不同的环境有着不同的故事,看见...
CGView Server:环形基因组可视化比较工具
CGView是一种画图工具,生成展示序列特性、基本组成片段、分析相似片段的圆形基因图解图,需要提供的序列为raw、FASTA、GenBank和EMBL格式, 另增加特性或者分析信息请在提交的GFF文件...
假基因研究进展
刘国庆 白音宝力高 邢永强 人类基因组中仅仅约 2%的 DNA 是用来编码蛋白质的,而剩余 98%的序列则一度 被认为是近中 性 进 化 过程中 产 生的 没有 功 能的 “...
新一代高通量测序技术SOLiD简介
目前市场上有四种高通量测序仪,分别是Solexa,454 (GS-FLX),SOLiD和Polonator。根据测序原理,它们可以被分为两大类:使用合成法测序(Sequencing by Synthe...
Vienna RNA:RNA二级结构预测与比对软件
Vienna RNA Package中包含了多个用于RNA二级结构预测和比对的程序,以下是官方文档中列出的比对工具: RNAfold predict minimum energy sec...
小分子 microRNA 及其生物学特征
王春梅,李庆章 反义RNA技术作为一种阻断或封闭特定基因表达的手段,已经被广泛地研究与应用...
ncFANs:non-coding RNA Function ANnotation Server
ncFANs是一个在线预测与注释人、小鼠等物种中长非编码RNA的在线服务器,它利用对芯片数据进行重注释,并预测ncRNA的功能。 下面是官方文档的介绍: Long noncoding RNAs (nc...
wapRNA:RNA与microRNA分析工具
wapRNA是一个RNA序列数据处理的网络平台,支持RNA和microRNA两种序列分析。它集成了多种分析工具,为处理下一代测序技术平台,如(Solexa,SOLiD)产出的RNA序列数据提供了便利。...