纪念查尔斯•达尔文诞辰200周年 作者简介:龙漫远,美国芝加哥大学生态与演化学系终身教授,北京大学生物信息中心长江学者讲座教授,主要从事遗传学与演化论研究;陈振夏,北京大学生物信息中心博士研究生, 主...
大米的逆袭:植物操纵了我们的身体吗?
科学家发现,植物中的一些微小RNA会进入人体,控制人体的基因活性,以更主动的方式影响人体。这是第一次实验证明,植物的微小RNA竟然是一个超级杀手,可以跨物种执行任务!这也许证明了“一方水土养一方人”,...
Sashimi-plot:isoform表达画图工具
以下是官方对Sashimi-plot的简单介绍: Sashimi-plot is a utility for automatically producing publication-quality p...
miRNEST:动植物中miRNA数据库
除了收集动植物miRNA及其功能的数据,已存的miRNA资源通常只收集有限数量物种的miRNAs。许多miRNAs,包括一些生物模型中的miRNA,都还没有被发现。因此,现在需要寻找新的microRN...
不确定性原理:进化如何两头下注
在变化的世界中,具有多样性是生存的关键。而进化似乎已经想到了一种不同寻常的方法产生更多的多样性。 一个人走进了一家酒吧。“我对进化有一种新的看法,”他宣布说,“你有什么东西可以让我把它写下来吗?”服务...
非自然的选择:人类是如何驱动进化的
人类活动不仅造成了大灭绝──我们还是存活物种进化的最大驱动力。 墨西哥的祖克(Zoque)人每年都会举行一种仪式,他们把一种有毒植物研碎、混合起来,倒进当地岩洞中的一条河里(如下图)。所有中毒而漂上水...
Velvet and Oases For Transcriptome Assembly(基于转录组进行拼接)
首先要有Linux环境的服务器或PC,推荐最低需求: 64bit Linux System (Rethat, CentOS, Fedora), 4 core CPU processors, 2.26G...
物理图谱
【相关概念】 DNA限制性内切酶酶切图谱又称DNA的物理图谱,它由一系列位置确定的多种限制性内切酶酶切位点组成,以直线或环状图式表示。在DNA序列分析、基因组的功能图谱绘制、DNA的无性繁殖、基因文库...
长链非编码RNA(lncRNA)简介
什么是长链非编码RNA? 长链非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是一类本身不编码蛋白、转录本长度超过200nt的长链非编码RNA分子,它可在多层面上(表观遗传调控、...
Inparanoid:寻找物种间直系同源基因的软件
Inparanoid是一个寻找物种间直系同源基因的软件,同时相应的网站目前包含了100 organisms, 1687023 sequences。 Inparanoid单机版程序是一款非常优秀的寻找直...