ScriptR绘图基础(10)热图 heatmap 我们在分析了差异表达数据之后,经常要生成一种直观图--热图(heatmap)。这一节就以基因芯片数据为例,示例生成高品质的热图。 比如 钢蓝渐白配色的热图 首先还是从最简单的heatmap开始。 &g... 01月28日46,9224ggplot2 R 阅读全文
ScriptR绘图基础(9)坐标中断(axis breaks) R当中的坐标中断一般都使用plotrix库中的axis.break(), gap.plot(), gap.barplot(), gap.boxplot()等几个函数来实现,例: gap plot &g... 01月28日6,544评论R 绘图 阅读全文
ScriptR绘图基础(8)点柱图(dot histogram) 在之前的一节当中,图型名称有些混乱,从这一节开始将做如下统一(不全面): 英文名称 中文名称 bar 条形图 line 线图 area 面积图 pie 饼图 high-low 高低图 pareto 帕... 01月28日5,930评论R 绘图 阅读全文
ScriptR绘图基础(6)各类图型 1、点,线,面 点:points,线:abline,lines,segments,面:box,polygon,polypath,rect,特殊的:arrows,symbols points不仅仅可以画... 01月28日5,573评论R 绘图 阅读全文
ScriptR绘图基础(5)坐标轴,图例,标记与标题 相关参数来控制,它们有 参数 描述 main 主标题 sub 副标题 xlab x轴标记 ylab y轴标记 xlim x轴上下限(范围) ylim y轴上下限 mgp 坐标轴标记,坐标字符,坐标刻度... 01月28日42,463评论R 绘图 阅读全文
ScriptR绘图基础(4)符号与线形 画图中的符号由pch参数来控制。其描边色由col控制,填充色由bg控制。 > pchShow <- + function(extras = c("*",".", "o","O","0","... 01月28日4,345评论R 绘图 阅读全文
ScriptR绘图基础(3)字体 字体参数如下: 参数 描述 font 字体描述,1正常,2加粗,3斜体,4加粗,斜体,5符号 font.axis 坐标轴字符描述 font.lab 坐标轴标记字体描述 font.main 标题字体描述... 01月28日8,593评论R 绘图 阅读全文
ScriptR绘图基础(2)颜色 计算机保存及还原颜色时有多种方案,较为常用的是两个,RGB和HSV。R预设了657种颜色,可以通过colors()函数调用(或者英式拼写colours())。比如我们常用的红,绿,蓝, > co... 01月28日11,832评论R 绘图 阅读全文
ScriptR绘图基础(7)综合应用 1、点阵图加两方向柱状图 > def.par <- par(no.readonly = TRUE) # save default, for resetting... > > x... 01月28日2,369评论R 绘图 阅读全文
Scriptqplot绘图函数快速入门 绘图是进行数据探索分析的重要方法,也是数据报告中的必备元素。但进行多元数据绘图时,R语言中的基本绘图工具往往很不给力,使用lattice包又要记一大堆命令。在你痛苦不堪的时候,需要ggplot2包来拯... 09月25日7,160评论教程 绘图 阅读全文