我们在分析了差异表达数据之后，经常要生成一种直观图－－热图(heatmap)。这一节就以基因芯片数据为例，示例生成高品质的热图。 比如 钢蓝渐白配色的热图 首先还是从最简单的heatmap开始。 &g...
ScriptR绘图基础（10）热图 heatmap
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ScriptR绘图基础（9）坐标中断(axis breaks)
R当中的坐标中断一般都使用plotrix库中的axis.break(), gap.plot(), gap.barplot(), gap.boxplot()等几个函数来实现，例： gap plot &g...
ScriptR绘图基础（8）点柱图(dot histogram)
在之前的一节当中，图型名称有些混乱，从这一节开始将做如下统一（不全面）： 英文名称 中文名称 bar 条形图 line 线图 area 面积图 pie 饼图 high-low 高低图 pareto 帕...
ScriptR绘图基础（6）各类图型
1、点，线，面 点：points，线：abline,lines,segments，面：box,polygon,polypath,rect，特殊的：arrows,symbols points不仅仅可以画...
ScriptR绘图基础（5）坐标轴，图例，标记与标题
相关参数来控制，它们有 参数 描述 main 主标题 sub 副标题 xlab x轴标记 ylab y轴标记 xlim x轴上下限（范围） ylim y轴上下限 mgp 坐标轴标记，坐标字符，坐标刻度...
ScriptR绘图基础（4）符号与线形
画图中的符号由pch参数来控制。其描边色由col控制，填充色由bg控制。 > pchShow <- + function(extras = c("*",".", "o","O","0","...
ScriptR绘图基础（3）字体
字体参数如下： 参数 描述 font 字体描述，1正常，2加粗，3斜体，4加粗，斜体，5符号 font.axis 坐标轴字符描述 font.lab 坐标轴标记字体描述 font.main 标题字体描述...
ScriptR绘图基础（2）颜色
计算机保存及还原颜色时有多种方案，较为常用的是两个，RGB和HSV。R预设了657种颜色，可以通过colors()函数调用（或者英式拼写colours()）。比如我们常用的红，绿，蓝， > co...
ScriptR绘图基础（7）综合应用
1、点阵图加两方向柱状图 > def.par <- par(no.readonly = TRUE) # save default, for resetting... > > x...
Scriptqplot绘图函数快速入门
绘图是进行数据探索分析的重要方法，也是数据报告中的必备元素。但进行多元数据绘图时，R语言中的基本绘图工具往往很不给力，使用lattice包又要记一大堆命令。在你痛苦不堪的时候，需要ggplot2包来拯...