热图 | Public Library of Bioinformatics

如何按照热图中的顺序输出表达量文件

大家在用热图软件，例如，pheatmap绘制热图的之后，经常要面临一个问题就是：图是画出来了，但如果想从图对应到基因，并查询对应基因的表达量就非常麻烦。因为热图聚类功能会打乱样本和基因的顺序，原来的...

03月10日6,605评论

加载所需R包 library(ComplexHeatmap) require(circlize) # 设置工作路径 setwd("/Users/Davey/Desktop/") # 清除当前环境中的变...

11月07日5,396评论

数据聚类然后展示聚类热图是生物信息中组学数据分析的常用方法，在R语言中有很多函数可以实现，譬如heatmap,kmeans等，除此外还有一个用得比较多的就是heatmap.2。最近在网上看到一个笔记文...

08月27日44,5402

上一篇《进化树+条形图：“组合图”的绘制》介绍了如何通过改变标尺来改变进化树分支长度和进化树的注释，相信大家对进化树与其他类型图表的组合有了一定的了解，局限于微信公众号的篇幅，其实还有好多东西没有讲到...

08月09日8,068评论

我们在分析了差异表达数据之后，经常要生成一种直观图－－热图(heatmap)。这一节就以基因芯片数据为例，示例生成高品质的热图。比如钢蓝渐白配色的热图首先还是从最简单的heatmap开始。 &g...

01月28日48,1904