推荐一个简单高效的图形化热图绘制工具

  • A+
所属分类:Script

热图(heatmap)绘制有很多方法,最多就是R了吧,Excel,MATLAB 也很常见,各种工具琳琅满目,这里我向大家推荐一款非常简单高效的热图绘制工具,更重要的是,它完全不需要命令行!!,完全满足了编程小白,编程大神,等等等等,对heatmap的所有基本需求。它内设了许多色系,直接选择最喜欢的就好,支持聚类,可以方便改动x轴和y轴标题的设置.....

先上图

1

 

数据导入支持excel,只要拖动鼠标,选择数值数据区域即可,默认是不显示X轴和Y轴标题的,如果需要,可以指定哪一行是x轴,哪一列是y轴。

技巧1:导入数据前,先点击DEMO,选择好喜欢的色系,这样导入数据后,就直接以该色系画图了

然后,小伙伴们就可以自由的修改这个heatmap了,包括,X轴,Y轴标题角度,字体,整个图片旋转,边距等等,基本的需求都能满足。每次修改后,都需要点击REFRESH进行刷新。

技巧2:如果绘制热图的数据跨度比较大,比如从1到100都有,那么强烈推荐先对数据做归一化,这个可以放心,软件能自动帮你完成,只需要两步,

1). 选择option的statistic按钮2

 

然后在这里选择log归一化的方式

3

 

2)点击Bar面板,选择“Auto Fill”按钮,再点ok,然后refresh一下就好

4

 

这个软件还可以做聚类。你可以根据需要选择对哪个轴做聚类,这个就不讲了,只要选择参数面板上的Clustering复选框就可以,简单明了。

 

导出图片,右键点击图片,你会看到导出选项,也是很简单,支持png,jpg,tiff,以及3种dpi,足够满足paper发表的质量。

 

这个工具还有一个小视频,可以去看下,如果实在不会的话。。。

http://hemi.biocuckoo.org/faq.php

 

 

avatar

发表评论

:?: :razz: :sad: :evil: :!: :smile: :oops: :grin: :eek: :shock: :???: :cool: :lol: :mad: :twisted: :roll: :wink: :idea: :arrow: :neutral: :cry: :mrgreen:

目前评论:51   其中:访客  51   博主  0

    • avatar 町语轩 0

      数据导入好像不支持excel,只能是xml格式的,怎么呀?

      • avatar 汤汤 0

        请问您有这个软件的安装包吗

        • avatar 本来 0

          同问 怎么导入excel文件呢 我在下拉菜单里选了office文件格式 上面显示有我要的表格 可是我点打开里面并没有加载出数据

          • avatar lumiaojia 0

            请问这个软件可以画spatial的heatmap吗 可以结合shapefile吗 比如说车流量大的公路显示为红色 车流量小的显示为绿色

            • avatar ppppp 0

              为什么我LOAD不进去数据,而且换了低分辨率的还是不行,是什么问题呢,上传的是.xls文件啊