大家在用热图软件，例如，pheatmap绘制热图的之后，经常要面临一个问题就是： 图是画出来了，但如果想从图对应到基因，并查询对应基因的表达量就非常麻烦。因为热图聚类功能会打乱样本和基因的顺序，原来的...

在画heatmap的时候，往往由于某种数据分析需要，需要获得聚类后的heatmap的col和row的顺序。这里展示如何从pheatmap的聚类结果中提取我们需要的信息。 这里通过产生随机数据来演示。 ...

数据聚类然后展示聚类热图是生物信息中组学数据分析的常用方法，在R语言中有很多函数可以实现，譬如heatmap,kmeans等，除此外还有一个用得比较多的就是heatmap.2。最近在网上看到一个笔记文...

热图绘制 热图是做分析时常用的展示方式，简单、直观、清晰。可以用来显示基因在不同样品中表达的高低、表观修饰水平的高低等。任何一个数值矩阵都可以通过合适的方式用热图展示。 本篇使用R的ggplot2包实...

我们在分析了差异表达数据之后，经常要生成一种直观图－－热图(heatmap)。这一节就以基因芯片数据为例，示例生成高品质的热图。 比如 钢蓝渐白配色的热图 首先还是从最简单的heatmap开始。 &g...

生物信息学中经常使用R 来画图，而R画heatmap的功能是非常强大的。通常，我的习惯是使用gplots包中的heatmap.2函数来进行画图。不过这个函数中不能对聚类分析（clustering）到方...

热图(heatmap)绘制有很多方法，最多就是R了吧，Excel，MATLAB 也很常见，各种工具琳琅满目，这里我向大家推荐一款非常简单高效的热图绘制工具，更重要的是，它完全不需要命令行！！，完全满足...

python里的matplotlib是一个很强大的绘图软件包。可以绘制类似matlab和R软件效果的图样。这几天尝试着从原始数据得到一个热度图。就用了这个软件包。效果还好。虽然软件很庞大很复杂，但是遇...