森林图是meta分析中hin重要又常见的元素，它以一条垂直的无效线为中心，用平行于横轴的多条线段表示每个被纳入研究的效应量和可信区间，用一个菱形描述合并的效应量及其可信区间。但，森林图具体怎么看呢?今...

箱线图 箱线图是能同时反映数据统计量和整体分布，又很漂亮的展示图。在2014年的Nature Method上有2篇Correspondence论述了使用箱线图的好处和一个在线绘制箱线图的工具。就这样都...

线图 线图是反映趋势变化的一种方式，其输入数据一般也是一个矩阵。 单线图 假设有这么一个矩阵，第一列为转录起始位点及其上下游5 kb的区域，第二列为H3K27ac修饰在这些区域的丰度，想绘制一张线图展...

热图绘制 热图是做分析时常用的展示方式，简单、直观、清晰。可以用来显示基因在不同样品中表达的高低、表观修饰水平的高低等。任何一个数值矩阵都可以通过合适的方式用热图展示。 本篇使用R的ggplot2包实...

CIRCOS图在有了染色体信息界定绘图区域后，就可以向里面添加离散数据如标记特定的区域或连续数据如展示修饰的丰度等。 经过前面部分对CIRCOS基本安装，最简单绘图和调整各部分属性的熟悉后，这些基本配...

CIRCOS圈图绘制 - 最简单绘图和解释介绍了CIRCOS的安装、基本的配置文件的解释、如何最简单的获得一个CIRCOS图。最主要的部分还是配置文件的位置信息和各个参数的含义解释。 本篇则处理染色体...

Circos是绘制圈图的神器，在http://circos.ca/images/页面有很多CIRCOS可视化的示例。 Circos可以在线使用，在线使用时是把表格转为圈图，不过只允许最大75行和75列...

【前言】其实这篇文章是为了简单介绍一下geneview的用法，它是一个Python高级库，建立在matplotlib的基础之上，专门用于基因组数据的可视化，目的是为了使创建高大上（精致）的基因组数据图...

《经济学人》常用的藏青色 经济学人上的图表，基本只用这一个颜色，或加上一些深浅明暗变化，再就是左上角的小红块，成为经济学人图表的招牌样式。罗兰贝格也非常爱用这个色，有时也配合橙色使用。各类提供专业服务...

ideogram在基因组绘图中往往表示的就是染色体，在大多数情况下，ideogram是配置文件中重要的部分，也是相对参数较多的circos配置文件。主要内容包括染色体的半径、宽度、颜色，染色体排列方式...