Seaborn(sns)官方文档学习笔记系列包括: 第一章 艺术化的图表控制 第二章 斑驳陆离的调色板 第三章 分布数据集的可视化 第四章 线性关系的可视化 第五章 分类数据的绘制 第六章 绘制数据网...
RIdeogram:画染色体图
由小丫画图开始并推动,产生了一个CRAN包——RIdeogram 今天已由CRAN审核通过,一行命令搞定安装: install.packages("RIdeogram") 【需求描述】 我要画差异表达...
基于R语言绘制坐标轴截断图
画图时经常遇到不同组的数据大小相差很大,大数据就会掩盖小数据的变化规律,这时候可以对Y轴进行截断,从而可以在不同层面(大数据和小数据层面)全面反映数据变化情况,如下图所示。 搜索截断图绘制的方法,有根...
HiC术语图解与分析软件汇总
序 言 接触HiC数据有一些时日了,想着总结一下关于HiC的一些特定术语以及数据分析的相关软件,做为备忘录的同时也可以方便后来的人。 先从概念开始,下面的示意图基本完美地展示了那些耳熟能详的术语所定义...
“进化树+点状图”组合图的绘制
在之前的3篇关于EvolView文章中已介绍过进化树的调整和注释,并重点介绍了进化树与条形图、热图、蛋白结构域的组合操作。这次为大家介绍另一种常见的组合图:进化树+点状图。 由于内容上有...
如何同时在一页绘制多个图表
有的时候我们需要绘制许多图表类型相似的图表,比如挑选多个基因做qPCR验证转录组数据,有时也需要绘制横轴一致的图表进行相互比较。对于下图这类堆叠图表,如果一个一个画,把做标轴的scale设成一样的,然...
使用ComplexHeatmap包绘制热图
加载所需R包 library(ComplexHeatmap) require(circlize) # 设置工作路径 setwd("/Users/Davey/Desktop/") # 清除当前环境中的变...
ComplexHeatmap绘制全基因组突变景观图
ComplexHeatmap R包是Zuguang Gu编写的,也是现在文章中利用的较多的R包。这个包能实现的功能很强大,今天给大家介绍一下利用ComplexHeatmap R包中的oncoprint...
基因富集通路图展示神器-Mapman的使用
大家还在为通路图中无法展示具体基因而发愁吗?还在为基因富集通路图展示出来不够美观而苦恼吗?今天小编给大家带来一款植物基因功能分析神器——Mapman,可帮您解决此问题,闲话不多说了,大家先找个安静的地...
利用R语言heatmap.2函数进行聚类并画热图
数据聚类然后展示聚类热图是生物信息中组学数据分析的常用方法,在R语言中有很多函数可以实现,譬如heatmap,kmeans等,除此外还有一个用得比较多的就是heatmap.2。最近在网上看到一个笔记文...