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RIdeogram:画染色体图

由小丫画图开始并推动,产生了一个CRAN包——RIdeogram 今天已由CRAN审核通过,一行命令搞定安装: install.packages("RIdeogram") 【需求描述】 我要画差异表达...
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基于R语言绘制坐标轴截断图

画图时经常遇到不同组的数据大小相差很大,大数据就会掩盖小数据的变化规律,这时候可以对Y轴进行截断,从而可以在不同层面(大数据和小数据层面)全面反映数据变化情况,如下图所示。 搜索截断图绘制的方法,有根...
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Glossary

HiC术语图解与分析软件汇总

序 言 接触HiC数据有一些时日了,想着总结一下关于HiC的一些特定术语以及数据分析的相关软件,做为备忘录的同时也可以方便后来的人。 先从概念开始,下面的示意图基本完美地展示了那些耳熟能详的术语所定义...
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Evolution

“进化树+点状图”组合图的绘制

在之前的3篇关于EvolView文章中已介绍过进化树的调整和注释,并重点介绍了进化树与条形图、热图、蛋白结构域的组合操作。这次为大家介绍另一种常见的组合图:进化树+点状图。   由于内容上有...
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Script

如何同时在一页绘制多个图表

有的时候我们需要绘制许多图表类型相似的图表,比如挑选多个基因做qPCR验证转录组数据,有时也需要绘制横轴一致的图表进行相互比较。对于下图这类堆叠图表,如果一个一个画,把做标轴的scale设成一样的,然...
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