Evolution

EvolView画进化树+热图:组合图的绘制

上一篇《进化树+条形图:“组合图”的绘制》介绍了如何通过改变标尺来改变进化树分支长度和进化树的注释,相信大家对进化树与其他类型图表的组合有了一定的了解,局限于微信公众号的篇幅,其实还有好多东西没有讲到...
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Evolution

进化树+图片:组合图的绘制

在一些高分文章中我们会看到类似下图这种添加了图片进化树,颜值高而且更直观。在之前已经介绍过进化树和条形图、热图、点状图、结构域示意图等的组合,但Evolview并不支持进化树和图片的组合。 (Natu...
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Script

利用ggseqlogo绘制seqlogo图

简介 sequence logo图用来可视化一段序列某个位点的保守性,据根提供的序列组展示位点信息。这方面有很多在线小工具可以完成,这里使用R包ggseqlogo进行可视化。 安装 安装方式有两种 #...
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Bioinformatics

用Prism绘制“中断”柱状图

Prism也是一款比较经典好用的科研作图软件,在高分文章中经常出现它的身影,如下面的例子。它是一款从原始数据分析到图表生成“一站式”流程化的软件,例如它可通过Raw data 自动在图中生成误差线(e...
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Bioinformatics

nVenn:绘制广义的准比例维恩图

今天介绍一种绘制韦恩图的新工具: nVenn:绘制广义的准比例维恩图 优势 nVenn可以通过输入包含标题,集合的数量、名称以及描述维恩图中每个区域的元素数目的文件,生成易于解释的n维维恩图的所有区域...
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Script

使用ggplot2绘制条形图

数据分析报告中经常会看见各种各样的条形图,如简单条形图、水平交错条形图、堆叠条形图、堆叠百分比条形图等,本文从R语言的角度,教大家绘制各式各样的条形图。 绘制离散单变量的条形图 从数据形式来看:有汇总...
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Bioinformatics

Co-occurrence网络图在R中的实现

作者:陈亮 单位:中科院微生物所, 编辑: 刘永鑫 编者按:上个月菌群月坛,在军科院听取王军组陈亮博士分享网络分析的经验,不仅使我对网络的背景知识有了更全面的认识,更使我手上一个关于菌根的课题有极大的...
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