MEGA构建系统进化树的步骤 Evolution

MEGA构建系统进化树的步骤

MEGA 是一个非常优秀的序列比对和系统进化树构建软件,使用方便,完全免费,可从其网站下载, 最新版本是4.0。下面是用MEGA构建系统进化树的简明操作流程(具体细节请参考相关MEGA教程及使用说明)...
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估计进化速率 Evolution

估计进化速率

估计进化速率的几种软件: 1 Beast 它使用MCMC的方法进行进化树的构建和一系列参数的估计,而且给出可信度区间。 它的结果比较准确,但是要得到最终的好的结果需要大量的尝试,修改各种参数使得结果最...
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DNA分子进化及其理论基础 Evolution

DNA分子进化及其理论基础

从19世纪60年代起,许多生物学家便开始着手重建地球上所有生命的进化历史,并以系统树的形式描述这部历史。传统上,构建系统树是利用化石证据,通过严密的推理或计算,来表示不同物种间遗传距离及进化顺序。但是...
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用RAxML构建极大似然进化树 Evolution

用RAxML构建极大似然进化树

张金龙 中国科学院植物研究所,jinlongzhang01@gmail.com   RAxML 是用极大似然法建立进化树的软件之一,可以处理超大规模的序列数据,包括 上千至上万个物种,几百至...
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