Cytoscape作图介绍 Bioinformatics

Cytoscape作图介绍

Cytoscape 的核心是网络,简单的网络图包括节点(node)和边(edge),每个节点可以是基因、miNRA或OTU等等;节点与节点之间的连接 (edge) 代表着这些节点之间的相互作用,包括蛋...
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如何用Cytoscape提升文章档次 Bioinformatics

如何用Cytoscape提升文章档次

做完microRNA芯片测序之后预测microRNA的靶基因,筛选重要的靶基因进行验证是研究中的常见套路,做出结果后写到文章Result里大致如下。 如果我是审稿人,看到这么干巴巴的一段话肯定心情烦躁...
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GSEA-基因富集分析 Bioinformatics

GSEA-基因富集分析

说到富集,富集是将基因根据一些先验的知识(也就是常见的注释)进行分类的过程。我们一般会想到最常见的是GO/KEGG富集,其思路是先筛选差异基因,然后确定这些差异基因的GO/KEGG注释,然后通过超几何...
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