在上一篇数据上传指南中，我们为大家介绍了GEO上传操作指南，今天小编就来介绍另一种重要的NCBI数据库SRA，它可用于存储测序的原始数据，实现资源共享。小编将SRA数据库的提交过程做一个简单概述，希望...

使用EBI的InterPro数据库，能对蛋白序列通过结构域方法进行基因家族分类注释。InterPro数据库整合了13个基因家族、结构域和功能位点的数据库，包括Pfam和CDD等。此外，InterPro...

生信分析过程中，会与很多不同格式的文件打交道，除了原始测序数据fastq之外，还需要准备基因组文件fasta格式和基因注释文件gtf格式。在分析的过程中还会有众多中间文件的生成，如bed、bed12、...

科研工作者在发表paper的时候，如果文章中涉及高通量测序数据分析，就需要提前向NCBI上传数据获得登录号。然而，如何向NCBI提交这些序列？今天就来介绍一种重要的NCBI数据库GEO，它可用于存储测...

序章 这个工具现在很火，高分文章用到很多。 加权基因共表达网络分析(WGCNA，Weighted gene co-expression network analysis) WGCNA能够从复杂数据中（...

这里推荐一个下载NCBI SRA数据的神器，pysradb。这是一个基于python开发的软件，支持从命令行运行，也可以作为python的package直接在python代码中调用。 命令行下所有参数...

细胞核内的染色质构像一般分以下几个层级 Chromosome Territories Compartment A/B Topologically Associating Domains (TADs) ...

Gene Expression Omnibus database (GEO)是由NCBI负责维护的一个数据库，设计初衷是为了收集整理各种表达芯片数据，但是后来也加入了甲基化芯片，甚至高通量测序数据！ ...

人类基因命名委员会(HUGO Gene Nomenclature Committee);人类基因组命名委员会! 其实有了NCBI的entrez ID，然后还有refseq里面的ID，还有ensembl...

1 定义 聚类分析（Cluster Analysis）是一类将数据所对应的研究对象进行分类的统计方法，它是将若干个个体集合，按照某种标准分成若干簇，并且希望簇内的样本尽可能地相似，而簇与簇之间要尽可能...