一项大型国际计划显示，与青少年在学校掌握的知识相比，人类基因组—— 一个人的遗传信息总和——包含有更多的蛋白质编码基因。当研究人员决定在上世纪90年代晚期对人类基因组进行测序时，他们专注于寻找那些用来...
迄今最详细人类基因组分析数据出炉
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迄今最详细基因功能图谱内容
在2001年，人类基因组计划产生了近乎完整的人类DNA。但是，研究人员还希望了解这些GS，CS，和TS是如何利用，控制或组织，比它们少得多的编码区域，造就活生生的人。 今天（9月6日），一个聚集了42...
Nature等30篇文章公布重大成果：基因功能图谱
这估计是本世纪最重大的生物医学发现了。今天ENCODE疯狂的在nature等一次发了30篇文章。主题只有一个“垃圾DNA不是垃圾”。 ENCODE项目(ENCyclopedia Of DNA Elem...
GBrowse访问数据制备
什么样的数据，数据制备为什么格式，保存为什么样的形式，GBrowse进行怎样的设置，基因组图谱上就可以展示出来了。 要展示什么样的数据？ 基因组注释数据，比如contig的拼接关系、功能基因的注释、基...
GBrowse安装记录
安装步骤 perl、mysql安装略过 apache安装 [shell] % cd httpd-2.x.xx % ./configure --prefix=$HOME/httpd/prefork --...
GBrowse的介绍与安装
什么是GBrowse？ The Generic Genome Browser (GBrowse) is a genome viewer. GBrowse是个开源的基因组浏览器； 是一个图形化展示基因组...
Testing SOAPdenovo2 Prerelease – V (map and scaff)
We would like to complete our description of SOAPdenovo2 commands and get into more interesting topi...
Testing SOAPdenovo2 Prerelease – IV
SOAPdenovo2 runs through the following steps - (i) generate the de Bruijn graph and store it (‘pregr...
Testing SOAPdenovo2 Prelease Version – III
This commentary is a continuation of previous one. We are adding some additional information in case...
Testing SOAPdenovo2 Pre-release Version II:pregraph_sparse
Our earlier commentary on SOAPdenovo2 provided a quick overview of an assembly. In the next few comm...