这一次将会带领大家实现mnist的手写数字识别，手把手教会你如何使用TensorFlow进行基本的操作。本次课程中，将会事无巨细地深入讲解每一个操作细节，为每一位读者提供最贴心的服务。 准备工作 安装...

摘要：本系列主要对tf的一些常用概念与方法进行描述。本文主要针对tensorflow的模型训练Training与测试Testing等相关函数进行讲解。为‘Tensorflow一些常用基本概念与函数’系...

为了确保单细胞转录组分析工具的可用性，许多开发人员已经做出了相当大的努力。到2021年5月28日，已经开发并提供了近1000种不同的生物信息学工具。 01 数据预处理 单细胞转录组原始测序数据的基本格...

在制备测序文库时，经常会增加PCR的步骤来扩增DNA片段。如何评估PCR的效果和影响，本文主要分享ENCODE中针对ChIP-Seq和ATAC-Seq标准来说明。 ENCODE中主要通过三个参数来反应...

摘要：本文主要对tf的一些常用概念与方法进行描述。为‘Tensorflow一些常用基本概念与函数’系列之二。 1、tensorflow的基本运作 为了快速的熟悉TensorFlow编程，下面从一段简单...

置换检验 置换检验，是Fisher提出的一种基于大量计算（computationally intensive），利用样本数据的随机排列（置换检验的核心思想，故名Permutation test），进行...

卷积神经网络 (CNNs / ConvNets) 卷积神经网络和上一章讲的常规神经网络非常相似：它们都是由神经元组成，神经元中有具有学习能力的权重和偏差。每个神经元都得到一些输入数据，进行内积运算后再...

日常工作的窘境 谈基因浏览器的必要性，不需要扯“各种基因组序列以及高通量测序数据爆炸性增长，满足基因组可视化、大规模基因组数据分析和应用需要”这些有的没的，只需要从日常实际需求出发就可以。 在日常数据...

经过了第四节的长文，我想大家基本上已经知道了一个WGS流程该如何构建起来了吧。但在那一节中限于篇幅有两个很重要的文件我没能展开来讲，分别是：BAM和VCF文件。这篇我们先说BAM文件。 什么是BAM ...

这篇文章很长，超过1万字，是本系列中最重要的一篇，因为我并非只是在简单地告诉大家几条硬邦邦的操作命令。对于新手而言不建议碎片时间阅读，对于有一定经验的老手来说，相信依然可以有所收获。在开始之前，我想先...