Sinha, R., et al 近期在 bioRxiv上发布了一篇题为 ‘Index switching causes “spreading-of-signal” among multiplexed...
Postdoctoral Fellow, Master or PhD positions in Biostatistics, Statistic Genetics, Bioinformatics, Systems Biology and Genomics at Shanghai Jiao Tong University
Postdoctoral Fellow, Master or PhD position in Biostatistics, Statistic Genetics, Bioinformatics, Sy...
conda下安装jupyter notebook
1、配置虚拟环境 首先按照《Conda常用命令》教程创建需要的虚拟环境，譬如base和deep。分别切换到这两个环境下执行以下命令。 下面名为deep的虚拟环境为例。 切换conda环境到deep c...
Nature Biotechnology专题：RNA测序的质量控制
ENCODE项目向我们揭示，人类基因组中超过70%能得到转录，只不过不会发生在同一个细胞里。为了研究如此多样的转录本，研究人员开发了许多技术，其中RNA测序（RNA-seq）是最全面也最有效的。 许多...
WES（3）snp-filter
其中freebayes,bcftools,gatk都是把所有的snp细节都call出来了，可以看到下面这些软件的结果有的高达一百多万个snp，而一般文献都说外显子组测序可鉴定约8万个变异！ 这样得到突...
总结卡方检验（Chi-square test）和费舍尔精确检验（Fisher exact test）的区别
之前我一直都没有弄清楚卡方检验和Fisher exact test的区别。今天花时间专门整理、学习一下。 卡方检验是一种用途很广的计数资料的假设检验方法。它属于非参数检验的范畴，主要是比较两个及两个以...
多重比对着色软件包 TEXshade 图解安装教程
【絮语】 TEXshade 是 Latex 的一个宏包，可以对 MSF或 ALN 格式的多重比对文件以不同的方式进行着色美化，并可以对重要的位置和区域作出标记。用 TEXshade软件包能做出来的多重...
置换检验(Permutation test)
Permutation test，也称置换检验，随机化检验或重随机化检验，是大牛Fisher首次提出的。由于Permutation test检验计算量大而限制了其应用和推广，以致不为人熟知。现在由于计...
Duplicate与PCR扩增偏向性
Duplicate是个老大难问题，但处理与否要看具体情况，比如做DNA样本的时候，一定会处理，而RNA样本选择不处理。接下来有一些解决方法，但是“但是”也会很多，接受现实吧~~~ 首先Duplicat...
Win8 x64 + Office Word 2013 x64 无法自动加载 Endnote X6 的解决方案
系统环境如下：win8 x64英文原版+office2013 x64 简体中文版+Endnote x6 网上有很多文章，关于64位Office Word 2013加载EndnoteX6的解决方案，但基...