我们一般平时较为常用的检验要属有参检验,但是其要求样本必须满足近似正态,无离群点,数据量大等要求;而有些时候其实很难都满足以上前提条件,则这时需要使用无参检验,其只关注数据的秩,但是无参检验有时也无法...
相对危险度(Relative Risk)VS率比(Rate Ratio)
最近有部热播的网剧《大话西游之爱你一万年》,其中五百年前的六耳猕猴假扮孙悟空各种招摇撞骗,沾花惹草,而五百年后的至尊宝(转世孙悟空)被迫各种背锅和还情债,看的小编哭笑不得。其实在临床科研中,也有“真假...
Win10下用Anaconda安装TensorFlow
笔者之前在学习TensorFlow,也在自己的笔记本上完成了安装,在PyCharm中进行学习。但是最近为了使用python的科学计算环境,我把之前的环境卸载了,并用Anaconda重新安装了Tenso...
GO和KEGG富集的R包clusterProfiler
一:下载安装该R包 clusterProfiler是业界很出名的YGC写的R包,非常通俗易懂,也很好用,可以直接根据cuffdiff等找差异的软件找出的差异基因entrez ID号直接做好富集的所有内...
置换检验(Permutation test),你可能不知道但一直在用!
Permutation test,也称置换检验,随机化检验或重随机化检验,是大牛Fisher首次提出的。由于Permutation test检验计算量大而限制了其应用和推广,以致不为人熟知。现在由于计...
对Protein序列进行InterPro注释
使用EBI的InterPro数据库,能对蛋白序列通过结构域方法进行基因家族分类注释。InterPro数据库整合了13个基因家族、结构域和功能位点的数据库,包括Pfam和CDD等。此外,InterPro...
UMI去重强行MarkDuplicates
使用fastp+gencore的去重流程以及fgbio流程均是默认把dups删除,而不是类似picard MarkDuplicates以及sambamba那样把dups标记到flags值中。不过应该可...
Jupyter Notebook介绍、安装及使用教程
一、什么是Jupyter Notebook? 1. 简介 Jupyter Notebook是基于网页的用于交互计算的应用程序。其可被应用于全过程计算:开发、文档编写、运行代码和展示结果。 简而言之,J...
基因组浏览器-可视化软件Integrative Genomic Viewer(IGV)
你会用到的网站: IGV 官网http://software.broadinstitute.org/software/igv/download~ Broadinstitute出品 Java versi...
阶梯设计(the stepped-wedge design)
前几天有位大夫过来咨询,他的问题是这样的:现在有一种已经在早期研究中被证明有效的提高妇科大夫技能的某种培训,现在想在更多医院开展这样的培训,并评价其效果。 如果您也碰到这种情况,您会考虑什么样的研究设...