WGCNA的各种安装方法 Transcriptomics

WGCNA的各种安装方法

相关网络在生物信息学应用中得到越来越多的应用。例如,加权基因共表达网络分析是一种用于描述芯片基因间表达相关模式系统生物学方法。加权相关网络分析(WGCNA)可用于寻找高度相关基因的聚类(模块)。 相关...
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基因表达分析(下) Transcriptomics

基因表达分析(下)

本系列教程包括: 基因表达分析(上) 基因表达分析(中) 基因表达分析(下)   回顾 首先对基因表达分析(中)做一个简单的回顾 研究基因表达的有如下工具:RNA-Seq,microarra...
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基因表达分析(上) Transcriptomics

基因表达分析(上)

本系列教程包括: 基因表达分析(上) 基因表达分析(中) 基因表达分析(下)   还在利用hisat, tophat这些耳熟能详的软件将read比对到基因组(转录组)上,然后统计每个基因的c...
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基因表达分析(中) Transcriptomics

基因表达分析(中)

本系列教程包括: 基因表达分析(上) 基因表达分析(中) 基因表达分析(下)   基因表达 什么是基因表达,如下是来自于维基百科的解释: Gene expression is the pro...
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学习WGCNA总结 Transcriptomics

学习WGCNA总结

在转录组数据处理过程中我们经常会用到差异表达分析这一概念,通过比较不同处理或不同组织间基因表达量(FPKM)差异来寻找特异基因,但这前提是你的不同处理或不同组织样本较少,当不同处理或组织有较多样本,如...
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RNA-Seq基因表达水平衡量方法 Transcriptomics

RNA-Seq基因表达水平衡量方法

小编注:近年来RNA-Seq被广泛应用,衡量基因表达水平的方法也开始多样化,例如RPK, RPKM, FPKM, TPM等。那他们之间有什么样的区别、以及怎样换算呢。最近看到一篇不错的博客,这里与大家...
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