单细胞轨迹分析dyno使用教程 Single Cell

单细胞轨迹分析dyno使用教程

在上一期的《单细胞轨迹分析知多少--拟时间分析比较》中我们介绍了45种单细胞轨迹推断分析软件方法在以下4个方面的比较: 准确性 可扩展性 稳定性 可用性 得出了几项重要结论: 轨迹推断(TI,traj...
阅读全文
Liger单细胞多组学分析:原理 Single Cell

Liger单细胞多组学分析:原理

因为最近的课题需要用到单细胞多组学整合分析的方法,因此我学习了一下liger这个单细胞下游分析R包,觉得它的数学原理和整合方法都挺优美的,尽管软件包中有一大堆bug和不便之处。我将写一个liger单细...
阅读全文
Seurat进行单细胞RNA-seq聚类分析 Single Cell

Seurat进行单细胞RNA-seq聚类分析

由于最近的课题需要使用单细胞数据,因此开始学习单细胞的一系列分析方法和流程,这里就记录一下使用seurat进行单细胞RNA-seq聚类分析的流程,包括一些降维的知识,函数的调用等等。降维算是一件不大不...
阅读全文