CNVnator可用于分析全基因组CNV。 软件依赖于root框架以及samtools。最终的可视化也是依赖于root软件，另外还有衍生的拓展程序CNVpytor。从更新时间以及介绍页面看，CNVpy...

“就提取几个序列，不需要命令行” ================================================== 刚接触生物信息学的同学，或者（和我一样）只是使用生物信息相关知识...

通常测序生成的reads要与参考基因组或参考转录组进行比对，或Pseudo-alignment。所以首先需要获取参考基因组和参考转录组信息。 Ensembl http://www.ensembl.or...

一、概述 非参数检验对于总体分布没有要求，因而使用范围更广泛。对于两配对样本的非参数检验，首选Wilcoxon符号秩检验。它与配对样本t检验相对应。 二、问题 为了研究某放松方法(如听音乐)对于入睡时...

1. Circos简介 Circos用于画基因组圈图。其帮助文档：http://www.circos.ca/documentation/tutorials/ 2. Circos的安装 Circs是pe...

在我们日常的工作中经常会用到微软的Word、Excel和PowerPoint等，可能很多人会忽略Visio这款软件。Visio是一款就复杂信息、系统和流程进行可视化处理、分析和交流的软件。它最早是由J...

之前我一直都没有弄清楚卡方检验和Fisher exact test的区别。今天花时间专门整理、学习一下。 卡方检验是一种用途很广的计数资料的假设检验方法。它属于非参数检验的范畴，主要是比较两个及两个以...

看了illumina的测序仪市场份额的确很夸张，像我这样在生信数据分析领域身经百战的老鸟，都是直到今天才碰到color space的测序数据。测序平台是AB 5500xl Genetic Analyz...

########################################################### ################### 一、下载安装circos及perl ##...

地址：ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/gene/DATA/ 里面主要有以下几个文件 我这里主要介绍gene2ensembl，gene2accession， gene2pubmed...