这个工具主要是针对不会bioperl不会API调取数据的生信纯菜鸟准备的，主要是方便大家批量研究某些感兴趣的基因，需要准备的数据就是基因名或者基因的ID号，能从该网站获取的资料非常多，可以是关于你的输...

打开官网：http://www.genome.jp/kegg-bin/get_htext?hsa00001%203101 http://www.genome.jp/kegg-bin/get_htext...

之前我提到过kegg数据库里面的有些pathway下面没有对应任何基因，当时我还在奇怪，怎么会有这样的通路呢？ 然后，我随机挑选了其中一条通路（hsa01000），进行查看，发现正好是所有的酶的信息。...

整个分析用TopHat进行比对，比对完成后将比对输出作为cufflinke拼接的输入（单独拼接），将单独拼接的结果使用cuffmerge混合，然后使用cuffdiff做差异，使用r软件包CummeRb...

1. 从意义上看： 指数分布解决的问题是“要等到一个随机事件发生，需要经历多久时间” 伽玛分布解决的问题是“要等到n个随机事件都发生，需要经历多久时间” 所以，伽玛分布可以看作是n个指数分布的独立随机...

在 蛋白质定量—MaxQuant软件的使用 这篇文章中介绍了如何使用MaxQuant进行蛋白质定量。但是只适用于样品少（11个样品以内）的分析，但是如果样品特别多（比如有18个样品）时，标记是不够用的...

最近为了了解下GSEA的算法的整体思路以及软件一些主要参数的具体含义，从头看了下其R代码，由于其R代码是作者在软件早期写的，其功能并不是很完善，但是其核心的思路还是在代码中体现出来了（其实主要还是GS...

01、PROGgeneV2 http://genomics.jefferson.edu/proggene/ PROGgeneV2可以分析乳腺、结直肠、卵巢、皮肤、眼、胸腺、肾上腺、胰腺、胃、甲状腺、膀...

二代测序二代测序是做什么的 如何选择好的barcode barcode组合举例 建库测序时barcode是如何发挥作用的 barcode，也叫index，在二代测序里面是用于区分不同样品的。为了避免概...

1 混合样本测序 现代测序仪的生产能力正在经历突飞猛进的提高，数据量远远大于单个样本测序所需，因此在很多情况下，需要把多个样本混合在一起测序，以充分发挥仪器的能力，节约测序成本。像外显子组测序、转录组...