基因组数据库-一个物种的官网 Genomics

基因组数据库-一个物种的官网

基因组数据库相当于一个物种的官网,关心该物种的科学家可以通过访问网站了解物种信息、科研进展、做blast等简单分析、下载基因组数据,基因组数据库最核心的模块是基因组浏览器,可以可视化查看基因结构、变异...
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VCF格式 Genomics

VCF格式

CHROM 染色体编号 POS 位置 ID 基因ID REF 参考基因组碱基 ALT 样本碱基 QUAL 变异可信度,越高越好 QUAL:Phred格式(Phred_scaled)的质量值,表 示在该...
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VCF格式解析 Genomics

VCF格式解析

VCF是用于描述SNP,INDEL和SV结果的文件,下面所记录的是以GATK软件结果的VCF文件,与SAMtools的结果有点不同 VCF文件可以分为两部分看,最上面#号注释的的部分是对一些参数的解释...
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基迪奥生物–招贤纳士 Advertisement

基迪奥生物–招贤纳士

销售代表 招聘人数:10人 岗位职责 1、负责所在区域内高通量测序销售执行、策划及推广,并完成销售任务; 2、市场、客户信息收集、整理及反馈; 3、组织和配合公司进行市场推广、学术讲座等活动。 任职条...
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统计BAM文件中的reads数 Bioinformatics

统计BAM文件中的reads数

当完成测序的比对工作之后,我们得到了bam/sam文件。那么,如何得到reads的统计数据呢? 这有很多途径: 1.读取日志文件。对于bowtie的日志,其中会包括如下的描述: 31991083 re...
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