Figtree可视化进化树文件

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所属分类:Evolution

 

下载软件

http://tree.bio.ed.ac.uk/software/figtree/

我们这里就在window平台下使用,所以直接下载zip包即可,解压即可使用

准备数据

我这里就简单的用muscle生成了一个树文件来看看结果TRAV.fa 是一百多个类似的基因

muscle -in TRAV.fa -out tmp

muscle -maketree -in tmp  -out TRAV.tree

这个树文件TRAV.tree是Newick format,可以直接被figtree识别从而画图

软件使用

很简单,下载,点击即可使用,然后导入树文件,就可以直接出图啦!

Figtree可视化进化树文件

原文来自:http://www.bio-info-trainee.com/660.html

ybzhao

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