Bioinformatics

三维基因组常用分析工具汇总

Hi-C技术主要将空间结构临近的DNA片段进行交联,并将交联的DNA片段富集,然后进行高通量测序,对测序数据进行分析即可揭示全基因组范围内的染色体片段间的交互作用。利用Hi-C技术可以揭示基因组的一般...
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Genomics

Hi-C文库相关性分析

Hi-C分析需要的测序量比较高,1个样本往往需要测序很多的数据量,1个Hi-C文库可测序的数据量有限(一般情况下100-300G PE150,超出这个量,多测的数据可能含有较高的PCR dup),所以...
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Bioinformatics

Hi-C文库数据质控及解读

数据自身的质量在很大程度上决定了分析结果的准确和可靠,随着Hi-C技术在三维基因组学上的快速推广,对于Hi-C数据本身的质量和测序深度也逐渐引起研究人员的重视。同时对该技术的进一步优化和改进使之能够在...
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