三维基因组技术(一):简单介绍

来源:Bioinfo鱼评论1,369

写在前面

  • 以下内容均来自我在菲沙基因(Frasergen)暑期生信培训班上记录的课堂笔记

1.基因组空间三维结构与功能

  • 染色质空间三维结构
  • 染色体结构
    DNA以一长串复杂的线圈形式堆积成染色体。DNA各线圈缠绕在若干组蛋白束上形成“串珠”结构。这些线圈构成一个染色质链。然后染色质折叠成许多环,再卷曲形成一个染色体。
染色体结构
染色质空间三维结构
  • 真核生物细胞核内染色质结构
真核生物细胞核内染色质结构
  • 原核生物细胞内拟核结构
原核生物细胞内拟核结构
  • 基因组结构与功能的关系

基因组在空间上形成特定的结构后发挥特定的功能,如基因组上的Enhancer通过折叠成环促使基因的表达等

loop结构与功能
loop结构与功能

2.三维基因组技术简介

  • 三维基因组手段是破解遗传机理的“关键钥匙”,通过三维基因组的手段来解析玉米中顺式调控元件的作用机制显得尤为重要
  • 三维基因组技术组成
三维基因组技术组成
  • 三维基因组学发展
三维基因组学发展
  • C系列技术起始——3C
3C
  • C系列技术——4C
4C
  • C系列技术——ChIA-PET
ChIA-PET
  • C系列技术——Hi-C
Hi-C
  • 三维基因组技术对比

整体思路:交联-酶切-连接-检测

维基因组技术对比

3.三维基因组技术应用

 

发表评论

匿名网友