差异表达分析之FDR Transcriptomics

差异表达分析之FDR

本文来自百迈客基因微信公众号(BMK_product) 随着测序成本的不断降低,转录组测序分析已逐渐成为一种很常用的分析手段。但对于转录组分析当中的一些概念,很多人还不是很清楚。今天,小编就来谈谈在转...
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RNA-Seq分析新工具 Transcriptomics

RNA-Seq分析新工具

利用RNA-Seq技术来分析转录组现在是一种很普遍的方法,在我读PhD期间分析过细菌的转录组数据。做差异表达分析的基本流程是:做质量控制->利用bwa map reads到基因组上->计算...
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用limma对芯片数据做差异分析 Transcriptomics

用limma对芯片数据做差异分析

用基因芯片的手段来探针基因表达量的技术虽然已经在逐步被RNA-seq技术取代,但毕竟经历了十多年的发展了,在GEO或arrayexpress数据库里面存储的全球研究者数据都已经超过了50PB了!实在是...
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差异基因分析方法 Transcriptomics

差异基因分析方法

在利用RNA-seq数据比较分析两个样品中同一个基因是否存在差异表达的时候,一般选取两个标准: i)FoldChange FoldChange,很容易理解了。就是两样品中同一个基因表达水平的变化倍数。...
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