DNA元件百科全书(Encyclopedia of DNA Elements, ENCODE)项目旨在描述人类基因组中所编码的全部功能性序列元件。ENCODE计划于2003年9月正式启动,吸引了来自美...
用图形和颜色来表现相关关系
进行数据分析建模首先要了解变量间的关系。对于连续数据来说,散点图可能是最为有效的一种工具。散点图通常对两组连续数据比较合适,如果是多元数据,那么可以使用散点图矩阵(ScatterMatrix)来两两展...
Linux、Unix常用命令(文件和目录相关)
mkdir mkdir dirname 建立子目录. 注意:用户不能在一个不存在的目录中建立子目录。 mkdir data 在当前目录下建立子目录 data mkdir /usr/data 在/usr...
高通量测序技术相关的名词解释
高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变,一次对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定,因此在有些文献中称其为下一代测序技术(next generation sequencing)足见其划时代的改变...
线性回归的假设和pearson相关系数的假设
pearson相关系数是最经常使用的相关系数,一般情况下我们会毫不犹豫的选择它,而大部分情况下都没有考虑到数据是否符合它的假设,如下所示: 1 两个变量间有线性关系 2 变量是连续变量 3 变量均符合...
使用R计算相关系数
使用R计算相关系数的函数为: cor.test(X,Y,method="") method可以为"spearman","pearson" and "kendall",分别对应三种相关系数的计算和检验。...
SPSS学习笔记之——相关分析(Pearson、Spearman、卡方检验)
卡方检验卡方检验一、相关分析方法的选择及指标体系 (一)两个连续变量的相关分析 1、Pearson相关系数 最常用的相关系数,又称积差相关系数,取值-1到1,绝对值越大,说明相关性越强。该系数的计算和...
Small RNA测序相关问题集锦
Small RNA是一大类调控分子,几乎存在于所有的生物体中。Small RNA包括:miRNA、ncRNA、siRNA、snoRNA、piRNA、rasiRNA等等。Small RNA通过多种多样的...
UCSC:基因组相关研究的一个有力工具
UCSC Genome Browser是由University of California Santa Cruz (UCSC) 创立和维护的,该站点包含有人类、小鼠和大鼠等多个物种的基因组草图,并提供...
Promoter预测的相关软件及各个软件比较
在过去几年各个实验室都开发了不同的Promoter prediction program(启动子预测软件),但每个promoter预测软件设计的立足点各有差异,如何选择一直以来是大家比较关注的问题。 ...