miRBase: http://www.mirbase.org miRBase序列数据库是一个提供包括已发表的miRNA序列数据、注释、预测基因靶标等信息的全方位数据库,是存储miRNA信息最主要的公...
GO分析的相关工具
GO委员会工具 AmiGO [http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/go.cgi] AmiGO提供检索和浏览GO委员会提供的本体学(ontology)...
蛋白注释相关的工具
随着蛋白质数量的增加,对于这些蛋白质的分类与注释成为一个非常活跃的课题。这里将包含所有蛋白质序列的集合称为nr库,在nr库中,序列与序列的相似性是不均等的,当我们使用blast进行序列两两比对的时候,...
awk行号相关的操作
一. 行距: 1. 每行间加一个空行 [code lang="bash"] awk '1; { print "" }' filname.ext #输出当前行,在输出一个空行 awk...
Fedora/Centos/Redhat及相关RPM资源收集及介绍
一、Fedora 官方资源: Fedora 官方站 Fedora 下载镜像 二、Fedora Extras (Fedora 计划的扩充资源)[重要] Fedora Extras(Fedora 扩展主站...
R语言基础和画图相关资料
http://www.r-project.org/ R 的官方网站 http://cran.r-project.org/manuals.html R 官方文档 http://www.biocond...
16S微生物宏基因组与宏转录组学数据分析实操班
微生物宏基因组学及后期数据分析专题培训班”的通知 各有关单位: 微生物作为地球环境中的一大类生物群体,每种微生物都有其独特的功能。微生物学(microbiology)作为生物学的分支学科之一,在许多学...
深度学习参数优化和训练技巧总结
寻找合适的学习率(learning rate) 学习率是一个非常非常重要的超参数,这个参数呢,面对不同规模、不同batch-size、不同优化方式、不同数据集,其最合适的值都是不确定的,我们无法光凭经...
Python画图系列教程
对于从事生物信息的人来说Python是一个非常强大的数据处理和分析的语言。初步处理完数据后,对于数据可视化,不少同学选择用R来画图,譬如强大的ggplot2系列的包。PLoB也建立专栏索引列出了ggp...
机器学习之特征选择(Feature Selection)
1 引言 特征提取和特征选择作为机器学习的重点内容,可以将原始数据转换为更能代表预测模型的潜在问题和特征的过程,可以通过挑选最相关的特征,提取特征和创造特征来实现。要想学习特征选择必然要了解什么是特征...