多个连续变量两两之间做简单相关,您还记得会输出什么样的结果吗?您喜欢这种输出方式吗?先放两张图,大家随意感受一下。 第一张,大家应该很熟悉,是11个变量两两之间的简单相关系数。这么多数字堆在一起,很难...
组内相关系数(Intraclass correlation coefficient,ICC) 的实现及模型选择
通过spss进行一致性检验(组内相关系数ICC及Kappa系数)。ICC参数由Analyze→Scale→Reliability Analysis过程完成得到; 选择恰当的ICC取决于以下三个方面,选...
NCBI的基因entrez ID相关文件介绍
地址:ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/gene/DATA/ 里面主要有以下几个文件 我这里主要介绍gene2ensembl,gene2accession, gene2pubmed...
chromVAR: 从单细胞表观数据中推断转录因子相关开放区域
chromVAR是一个用于分析稀疏染色质开放的R包。chromVAR的输入文件包括,ATAC-seq处理后的fragments文件(过滤重复和低质量数据), DNAse-seq实验结果,以及基因组注释...
GATK使用方法详解(相关参数和参考文件说明)
VariantRecalibrator参数详解 VariantRecalibrator -badLodCutoff 当LOD得分低于这个值的时候,就用于构建高斯混合模型的bad variants。默认...
2013年生物信息相关SCI杂志的影响因子
下面是2013年SCI杂志的影响因子,生物信息相关部分。提取出来供大家分享: 图片版部分,点击查看大图:
回归模型相关重要知识点总结
回归分析为许多机器学习算法提供了坚实的基础。在这篇文章中,我们将总结 10 个重要的回归问题和5个重要的回归问题的评价指标。 一、线性回归的假设是什么 线性回归有四个假设: 线性:自变量(x)和因变量...
偏相关系数
在多元相关分析中,简单相关系数可能不能够真实的反映出变量X和Y之间的相关性,因为变量之间的关系很复杂,它们可能受到不止一个变量的影响。这个时候偏相关系数是一个更好的选择。 偏相关系数是在排除了其他变量...
【SPSS】简单相关分析
马克思说联系是普遍的,世界上一切事物都处于普遍联系之中!相关就是联系的一种。谈到相关,肯定是至少两个变量间的关系,一个变量是无所谓相关的。根据两个变量的类型不同,在考察相关时用到的相关指标也会不同。一...
7.功能基因组相关信息分析(生物信息学教程系列)
生物信息学教程系列 第七章 7 功能基因组相关信息分析 功能基因组学是后基因组研究的核心内容,它强调发展和应用整体的(基因组水平或系统水平)实验方法分析基因组序列信息阐明基因功能,特点是采用高通量的实...