详细的安装及配置步骤请参见iprscan的文档Installing_InterProScan.txt 1.在安装iprscan之前，你的linux系统需要如下基本组件： PERL，这个常见的linux...

直接iprscan是不行的，需要加个-cli才能正常运行，不然出现一大堆HTML的代码，这里的cli 是command-line interface 简写。 usage: ./iprscan -cli...

1. kmer值 kmer值哪个比较好很难说，对不同的数据，用不同的kmer值会有很不同的结果。最好的办法就是测试不同的kmer，然后看结果的N50，找到N50最高的kmer。不过SOAPdenovo...

对于蛋白质序列，计分矩阵主要用于记录在做序列比对时两个相对应的残基的相似度，一旦这个矩阵定义好了以后，比对程式就可以利用这个矩阵，尽量将相似的残基排在一起，以达到最好的比对。 得分矩阵主要有两种，第一...

GenBank,SwissProt和EMBL文件中物种属性是一条注释。所有要做的工作就是检查序列注释信息看看物种属性是否符合要求物种属性的名称依赖于数据源，在EMBL,SwissProt中用"OS"表...

大多数Biojava序列对象是不可改变的。这样的安全特性能避免对数据完整性的破坏。这样，在序列对象中就没有setName()这样的方法。有一种办法是用原始序列作为参数创建原始序列对象的视图。 通过使用...

  测序公司发送的测序结果一般有一个峰图文件和一个序列文件，峰图文件为Ａbi格式，用chromas软件（网上可下载）打开． 四种颜色的波形代表四种碱基的信号强度； 正常的峰图，波峰与波谷清晰...

GBrowse之频率直方图，有称为频率分布图，Generating Feature Frequency Histograms，用以展示这些统计信息，可以表意以下信息： 不同区段内基因组Gene或者SN...

Gbrowse图谱可以分为三部分，overview，region，details，每一部分都可以显示0到多个的映描（track），对于trace的定义，可以分为以下几部分：  track显示的内容，显...

用centos的会发现，有时候系统处于空闲状态，但是内存全部被消耗。 其实这事是一个假象，内存不是真实的被消耗而只是被用作缓存，当系统有程序运行这些内存还是能够用于程序运行的。 如果想尽快释放缓存，可...