首先要有Linux环境的服务器或PC，推荐最低需求： 64bit Linux System (Rethat, CentOS, Fedora), 4 core CPU processors, 2.26G...

RNA-PET是一种用第二代测序平台（Illumina GA和SOLiD）分析全长转录本的双末端标签（PET）测序的方法。和传统的随机剪断序列成短片段的RNA-Seq方法不同，RNA-PET捕获并测序...

RNA-SeQC是一个计算一系列对RNA-Seq数据进行质量控制的计量学的java程序。输入内容可以是一个或者多个BAM文件。输出文件是则包括计量数据的HTML报告和tab delimited文件。这...

对于复杂的组学数据，能尽可能方便地直接观察数据对于数据的分析和解释都非常重要，对新一代测序数据的可视化和交互展示是一个非常重要但容易被人忽视的问题.不深入考查数据的细节，而是满足于对数据的统计分析，是...

获得RNA-seq的原始数据后，首先需要将所有测序读段通过序列映射（mapping）定位到参考基因组上，这是所有后续处理和分析的基础.在读段定位之前，有时还需要根据测序数据情况对其做某些基本的预处理....