Transcriptomics

转录组数据饱和度评估方法

基因表达分析里面,RNA-seq是现在转录组研究常用的技术了,但是通过二代测序获得数据后,在正式分析前我们通常需要做两件事情:其一是reads的饱和度分析,另一个是RNA-seq测序的数据与mRNA真...
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纵观转录组研究

如今人们进行转录组分析大多是在第二代测序平台上进行RNA-seq,将样品中的RNA反转录为cDNA,构建测序文库,再进行测序分析。随着RNA-seq技术的逐渐普及,自然也出现了许多RNA-seq分析工...
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如何研究基因调控(专家点评)

随着基因组学研究的深入,人们已经不再满足于了解基因的功能,而是对基因调控表现出愈加浓厚的兴趣。现在,我们知道,DNA甲基化和组蛋白修饰可调控基因,microRNA和非编码RNA也可以。基因调控的研究工...
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差异表达基因的分析(2)

应学生及个别博友的要求,尽管专业博文点击率和反应均很差,但在去San Diego参加PAG会议之前,还是抽时间给出【R高级教程】的第二专题。专题一给出了聚类分析的示例,本专题主要谈在表达谱芯片分析中如...
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表达谱芯片的聚类分析

【在国际上,R软件的应用是数据分析的主流发展趋势之一,但我发现在国内R软件的使用远不如SPSS、SAS等软件那么流行。为推广R软件的使用,本博客将陆续推出“R高级教程”系列专辑,希望对生命科学领域的科...
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