问题的引入： 在处理DNA数据的时候，我们可能想枚举n-turple的全部可能形式。 即1-turple的时候，对应 ['A','T','C','G'] 而2-turple的时候，对应['AA','A...
NCBI的COG介绍
什么是COG？ “COG”是Cluster of Orthologous Groups of proteins（蛋白相邻类的聚簇）的缩写。构成每个COG的蛋白都是被假定为来自于一个祖先蛋白，并且因此或...
第二代测序数据处理工具软件汇总
Integrated solutions * CLCbio Genomics Workbench – de novo and reference assembly of Sanger, Roche F...
GenomicTools:一个高通量分析基因组的扩展计算平台
GenomicTools是一个灵活的计算平台，主要用来分析和处理高通量测序数据，比如RNA-Seq 和 ChIP-Seq。GenomicTools可以完成在基因组区域集中各种数学运算，因此可以设计一个...
WGCNA: an R package for weighted correlation network analysis
WGCNA: 是一个基于R语言编写的综合性加权关联网络分析软件，可以用于基因的共表达网络分析。主要分析功能有： network construction, module detection gene ...
NCBI在线BLAST使用方法与结果详解
BLAST（Basic Local Alignment Search Tool）是一套在蛋白质数据库或DNA数据库中进行相似性比较的分析工具。BLAST程序能迅速与公开数据库进行相似性序列比较。BLA...
Blastall常用参数简析
BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) 基本局部比对搜索工具，是一套在蛋白质数据库或 DNA 数据库中进 行相似性比较的分析工具，它是基...
Formatdb 命令行参数详解
formatdb - 得到 formatdb 所有的参数显示（见附录二）和介绍，它可以根据我们的想法把源数据库格式化. 主要参数的说明: -i 输入需...
GO分析的相关工具
GO委员会工具 AmiGO [http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/go.cgi] AmiGO提供检索和浏览GO委员会提供的本体学(ontology)...
在线分子生物学数据库索引
《核酸研究（Nucleic Acids Research）》搜集其上发表的或者其他杂志上发表的关于数据库的文章，建立的数据库索引。并且建立了一个分类系统，将这些数据库资源进行分类。建立的资源大多会发文...