Transcriptomics

RPKM, FPKM, TPM区别

在RNA-Seq的分析中,对基因或转录本的read counts数目进行標准化(normalization)是一个极其重要的步骤,因为落在一个基因区域內的read counts数目取决於基因长度和测序...
阅读全文
Statistics

相对危险度(Relative Risk)VS率比(Rate Ratio)

最近有部热播的网剧《大话西游之爱你一万年》,其中五百年前的六耳猕猴假扮孙悟空各种招摇撞骗,沾花惹草,而五百年后的至尊宝(转世孙悟空)被迫各种背锅和还情债,看的小编哭笑不得。其实在临床科研中,也有“真假...
阅读全文
Evolution

QTL 定位的原理

1. 连锁分析的基本原理 既然群体中产生了多样性,我们就期望将与性状相关的基因定位出来。在之前的文章中,我们提到功能基因定位的方法主要包括QTL定位(包含GWAS)和群体遗传(选择压力分析)。这里的Q...
阅读全文
Script

用SPSS做差异显著性分析后如何标记“abc”

科学论文和杂志中最常见的是用“字母”和“星号”标记差异显著性,如果所要比较的数据较少,用“*”号标记比较简单明了,而数据较多时就可能会用到了今天要讲的“字母标记法”。 今天的内容分两个部分:“心法”和...
阅读全文