Genomics

GEO数据做生存分析

一、数据下载 打开GEO,选择GSE17538 数据,然后下载MINiML。 二、格式转化 然后导入GEO_Convert.exe 工具。 导出样本信息数据和数据矩阵。 三、格式修改(可以防止踩大坑)...
阅读全文
Transcriptomics

转录组组装工具StringTie

StringTie由约翰霍普金斯大学联合德州大学西南医学中心开发,能够组装转录本并预计表达水平。它应用网络流算法和可选的denovo组装,将复杂的数据集组装成转录本。 相对于其他拼接软件(Cuffli...
阅读全文
Statistics

样本量太大,怎么办?

在开展研究前需要通过估计样本量来确定研究中应纳入多少研究对象。而且大多数同学们肯定对样本量估计方法有一定的了解。但是,我相信大家都会有这样的无奈:计算出来的样本量太大了,臣妾做不到……怎么破? 我们都...
阅读全文