GATK使用方法详解 Bioinformatics

GATK使用方法详解

一、使用GATK前须知事项: (1)对GATK的测试主要使用的是人类全基因组和外显子组的测序数据,而且全部是基于illumina数据格式,目前还没有提供其他格式文件(如Ion Torrent)或者实验...
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基因投错票,导致肿瘤 Popular Science

基因投错票,导致肿瘤

说起肿瘤,大家都知道肿瘤是一种致命的疾病,是失控的细胞异常增生。同时大家又对肿瘤有许多的神秘感。 今天,我就用一种新的视角来试着解释一下“肿瘤的发生的原因”。希望能给大家揭开“肿瘤发生机制”头上神秘面...
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GATK使用方法详解(初步分析) Bioinformatics

GATK使用方法详解(初步分析)

这一步主要是对上面所得到的最终vcf中的结果进行一些初步的分析,比如计算这些变异位点在dbsnp中的比例、Ti/Tv的比例、每个样本中的snp数量……。此外,还可以对变异位点的同义/非同义突变进行统计...
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