illumina SNP 芯片的CNV和LOH的分析

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所属分类：Bioinformatics

Illumina全基因组SNP芯片不仅可以call snp，还可以call CNV和LOH等结构性的变异。对于结构性变异的鉴定是通过BAF和logRratio来计算。CNV和LOH的区别在于CNV中logRratio 会变化，而LOH中不会。

常用的软件有：CNVpartition；QuantiSNP；PennCNV；dChip;illumina官网还提供了其余一些方法，可是都是商业软件，需要购买。而上面几个是免费的。

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    • avatar 杨 0
      回复 2018/08/06 下午 2:47  沙发

      您好，请问您这边是否通过SNP芯片检测LOH,TAI及LST,价格多少一例

        • avatar 果壳生物 0
          回复 2018/12/10 上午 11:54  1层

          @杨 可以联系果壳生物