使用cnvkit来对大批量wes样本找cnv Genomics

使用cnvkit来对大批量wes样本找cnv

cnvkit被设计来处理同一个批次的多个肿瘤配对样本测序情况,首先对所有的normal数据进行bin处理拿到背景值,然后就这个背景值来处理所有的tumor测序数据计算拷贝数变异情况。 该软件使用比较复...
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Gbrowse SNV突变频率图绘制 Genomics

Gbrowse SNV突变频率图绘制

基因组的某位置,会发生突变,或者说对于多个物种的个体进行测序的话,会发现许多位置不是稳定的只是某个碱基,而应该用频率表示,ACTG出现的频率,如果某个位置有出现两个以上碱基的可能性,我们就将这个位置称...
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