Transcriptomics

纵观转录组研究

如今人们进行转录组分析大多是在第二代测序平台上进行RNA-seq,将样品中的RNA反转录为cDNA,构建测序文库,再进行测序分析。随着RNA-seq技术的逐渐普及,自然也出现了许多RNA-seq分析工...
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Bioinformatics

RNA-seq数据分析方法

最近读到一篇Nature Method上一篇关于RNA-seq数据分析的文章,觉得很不错,杜宇刚开始多转录组分析的同学很有帮助,里面还介绍了一些关于可变剪接的问题。 下面列上列上的基本信息: Comp...
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Advance

最新研究质疑RNA测序数据的统计分析

过去几年间,高通量RNA测序已经取得了一些意想不到的成果,其中一些似乎是能够改写传统遗传学智慧的突破性发现。但是,这些调查结果现在受到了挑战,计算生物学家警告说,在这些数据密集型研究(data-int...
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Bioinformatics

测序数据分析工具大全

目前有不少用于基因组装配和比对的程序和算法,但是该选哪一个呢?许多序列分析的专家认为,这取决于基因组的大小、读取有多长,以及采用的是哪种测序技术。通常,软件还需要优化,以满足每个实验室的独特需求。在此...
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