说到富集，富集是将基因根据一些先验的知识（也就是常见的注释）进行分类的过程。我们一般会想到最常见的是GO/KEGG富集，其思路是先筛选差异基因，然后确定这些差异基因的GO/KEGG注释，然后通过超几何...

1.已经确定研究的基因，但是想探索他潜在的功能，可以通过跟这个基因表达最相关的基因来反推他的功能，这种方法在英语中称为guilt of association，协同犯罪。 2.我们的注释方法依赖于TC...

最近为了了解下GSEA的算法的整体思路以及软件一些主要参数的具体含义，从头看了下其R代码，由于其R代码是作者在软件早期写的，其功能并不是很完善，但是其核心的思路还是在代码中体现出来了（其实主要还是GS...