基因表达标准化 不同样品的测序量会有差异，最简单的标准化方式是计算 counts per million (CPM)，即原始reads count除以总reads数乘以1,000,000。 这种计算方...
DESeq2差异基因分析和批次效应移除
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R语言DESeq找差异基因
一：安装并加装该R包 安装就用source(“http://bioconductor.org/biocLite.R”) ;biocLite(“DESeq”)即可，如果安装失败，就需要自己下载源码包，然...
别再用DEseq2和edgeR进行大样本差异表达基因分析了
读博那几年，闲着没事就喜欢做各种软件的测试对比。有时候几个转录组样本非得用两三个差异分析方法都做一遍。严谨起来就给它们之间求一个交集，狡猾起来就谁的结果「更好」就用谁（想必你也是这么做的）。 2021...
miRNA测序结果分析
miRNA研究现在是如火中天了，不少同学现在也开始从事这方面研究。有些同学常常会迷惑，因为不知道到底需要做哪些研究。下面简单和大家分享一下miRNA测序后分析的主要内容有哪些。 一、基因注释（推荐） ...