你会用到的网站： IGV 官网http://software.broadinstitute.org/software/igv/download～ Broadinstitute出品 Java versi...
基因组浏览器-可视化软件Integrative Genomic Viewer(IGV)
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相关性分析的可视化_相关系数图的绘制过程
多个连续变量两两之间做简单相关，您还记得会输出什么样的结果吗?您喜欢这种输出方式吗?先放两张图，大家随意感受一下。 第一张，大家应该很熟悉，是11个变量两两之间的简单相关系数。这么多数字堆在一起，很难...
二十大数据可视化工具点评
如今学习应用数据可视化的渠道有很多，你可以跟踪一些专家博客，但更重要的一点是实践/实操，你必须对目前可用的数据可视化工具有个大致了解。以下是Netmagzine列举的二十大数据可视化工具...
数据挖掘后用什么样的效果来可视化数据呢？
生物信息在很大的一方面就是做数据的可视化。我们也经常想尽千方百计，想出好的点子来展示自己的数据，用一张生动、形象的的图片阐述其中的生物学故事。近期在网上看到一篇不错的文章，该文章罗列了一系列的数据可视...
MapView：海量短序列比对结果的可视化软件
前面刚给大家介绍了一款reads mapping的软件《MapNext：推荐一款可以用于做可变剪接mapping和SNP分析的软件》，大家有兴趣的可以试试。现在再给大家介绍一款短reads（譬如sol...
基因组可视化工具GBrowse及其应用
唐碧霞 王彦青 陈旭 庞博 赵文明 (中国科学院北京基因组研究所，北京，100029) 摘 要 高通量测序技术的发展使得测序数据量大规模的增长，从而为研究人员的数据分析工作带来了 挑战。基因组可视化工...
GBrowse访问数据制备
什么样的数据，数据制备为什么格式，保存为什么样的形式，GBrowse进行怎样的设置，基因组图谱上就可以展示出来了。 要展示什么样的数据？ 基因组注释数据，比如contig的拼接关系、功能基因的注释、基...
Tablet:Next Generation Sequence Assembly Visualization
Tablet is a lightweight, high-performance graphical viewer for next generation sequence assemblies a...
PyMOL–一款强大的开源分子可视化系统
最近由于在课题中发现氨基酸序列在pfam中又有了新的预测结果(SMART中没有,看来pfam数据更新更频繁),于是又需要进行一些序列的二级及三级结构简单预测,并进行相关的观察,由于很久没有搞这些东西了...