Glossary

基因芯片技术介绍

1990年,著名的人类基因组测序计划(Human Genome Project,HGP)正式启动,从此揭开了基因组时代的序幕。截至2006年8月,美国国立生物技术信息中心(NCBI,National ...
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Advance

Nature年度技术:基因组编辑

时近岁末,各大杂志接连进行了年终盘点,上周出版的《Nature》杂志也对2011年进行了回顾:365 days: Nature's 10 ,评点了2011年的科技进展,科技政策以及重要人物。其中《Na...
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Genomics

BreakDancer的安装与使用

安装BreakDancer总共需要完成以下三个软件的安装工作 Perl Samtool BreakDancer Software 安装perl语言 (一般linux系统已经自带了)以及相关的packa...
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Genomics

Velvet使用方法及参数介绍

Velvet简单介绍: velvet是一款常用的基因组拼接软件,与soapdenovo一起常用于二代测序数据的处理,相对于soapdenovo拼接的完整性更好。他能同时支持fasta、fastq格式的...
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Evolution

用RAxML构建极大似然进化树

张金龙 中国科学院植物研究所,jinlongzhang01@gmail.com   RAxML 是用极大似然法建立进化树的软件之一,可以处理超大规模的序列数据,包括 上千至上万个物种,几百至...
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Transcriptomics

Bowtie使用介绍

Bowtie是一个超级快速的,较为节省内存的短序列拼接至模板基因组的工具。它在拼接35碱基长度的序列时,可以达到每小时2.5亿次的拼接速度。Bowtie并不是一个简单的拼接工具,它不同于Blast等。...
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